创科路上-港大开发新型平台 快速筛选精确基因
2023-06-20 富美财经 浏览量:次
香港大学李嘉诚医学院(港大医学院)的研究团队开发新型测试平台,可同时试验及改造数以百计精准的碱基编辑器变体,突破现时基因编辑工具需逐一测试的限制,快速找出最适用和有效的基因治疗工具,成为全球首个筛选精确基因编辑工具平台。 研究团队成功将早前开发的先进技术CombiSEAL1及碱基编辑报告系统合并建立成一个新平台,可快速构建出数百种或以上的碱基编辑器变体,各变体具有不同脱氨酶和建基于CRISPR / Cas9的DNA识别结构域,这些变体的兼容性和性能尚需一一进行识别和比较。 碱基编辑是一种改良自CRISPR的新型基因编辑技术,并逐渐被视为可通过修正DNA来治疗因单个碱基突变基因而引致的相关疾病如镰刀型细胞贫血症、家族性高胆固醇血症等的安全基因治疗工具。 现有的基因编辑结果会因应碱基编辑器的类型、版本、目标DNA序列组成及碱基位置不同而有所差异。使用一个次优的碱基编辑器有机会导致错误编辑或产生额外突变,而导致不符理想的结果。为了使碱基编辑在每个治疗位点上的用途更尽完善,研究员必须耗时费力地对数十种现有碱基编辑器的性能逐一测试。 因此,平台可以大量读取每个变体的编辑效率、纯度、DNA序列组成偏好以及在人类细胞中产生单一和多个碱基转换的偏差,从而在最短时间、最小误差的情况下,挑选出最适用于基因治疗的变体。 港大医学院生物医学学院副教授黄兆麟博士解释道:“这就像在商店中的快捷结账通道。由于所有货品(即碱基编辑器变体)均带有特殊标记,在使用自助结账机扫描时,我们只需将所有货品一次过放入结账机的篮子中,扫描器即可自动识别所有货品并完成付款(即在我们的案例中进行碱基编辑性能分析)。这样就无需扫描每件货品,就如不需逐一测试每个碱基编辑器。”该研究结果已于《Cell Systems》期刊发表,并已就此技术提交相关专利申请。
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